Высшее духовное учебное заведение в Московской епархии — Коломенская духовная семинария. Её ректором является протоиерей Вадим Суворов, назначенный решением Священного Синода 25.08.2022 года (Журнал №70) и сменивший занимавшего с 2012 г. эту должность епископа Зарайского Константина. Семинария имеет бессрочную государственную лицензию на право ведения образовательной деятельности № 0114 от 29 мая 2012 г. высшего профессионального образования «Программа подготовки священнослужителей и религиозного персонала православного вероисповедания».
В настоящее время семинария занимает комплекс новопостроенных зданий, который в 2012 г. во время своего визита в Коломну освятил Святейший Патриарх Кирилл. Все учащиеся проживают в комфортабельном общежитии, по 3–6 студентов в комнате. Обучение и проживание бесплатное, студенты обеспечены четырехразовым горячим питанием. Классы оборудованы по последнему слову техники, в семинарии есть библиотека с читальным залом, лингафонный кабинет, компьютерный класс с подключением к сети Интернет, медпункт, пошивочная мастерская, тренажерные залы и футбольное поле. Студентам также выплачивается ежемесячная стипендия, а сотрудники и преподаватели получают зарплату.
Администрация семинарии старается поощрять успехи студентов в учебном процессе. Одной из форм поощрения лучших по успеваемости и поведению студентов является присуждение стипендии имени святителя Филарета, митрополита Московского и Коломенского.
В Коломенской православной духовной семинарии ведется преподавание 57 учебных дисциплин, трудятся 72 сотрудника и 54 преподавателя. Из них 5 человек имеют ученую степень доктора наук, 19 — кандидата наук, 4 — магистра, 3 — ученое звание профессора и 3 — доцента, 44 — высшее богословское образование, 38 — высшее светское образование. 40 преподавателей — священнослужители Московской епархии. Семинаристы через общение с духовенством получают возможность прикоснуться к опыту церковной жизни епархии, получить информацию «из первых уст» о задачах, стоящих перед Церковью, о жизни приходов и монастырей, о путях решений различных проблем церковной жизни. В компьютерной сети интернет действует сайт www.kpds.ru, где собрана вся справочная информация о семинарии.
Духовное образование не заканчивается после окончания семинарии. Во исполнение решений Архиерейского Собора в 2013 г. была создана Аттестационная комиссия, которую возглавил ректор Коломенской семинарии епископ Зарайский Константин. Комиссии вменяется в обязанность проводить аттестацию новорукоположенного духовенства.
Активную деятельность ведет хор Коломенской православной духовной семинарии. Хор семинарии входит в состав Хора духовенства Московской митрополии, которым руководит преподаватель семинарии священник Сергий Голев. Студенты КПДС в составе Хора духовенства Московской митрополии участвовали в Патриарших богослужениях, в торжествах, посвященных празднованию
Для поступающих в КДС в 2021-2022 учебном году
